htsjdk.samtools htsjdk.samtools.apps htsjdk.samtools.cram htsjdk.samtools.cram.build htsjdk.samtools.cram.common htsjdk.samtools.cram.digest htsjdk.samtools.cram.encoding htsjdk.samtools.cram.encoding.huffman htsjdk.samtools.cram.encoding.huffman.codec htsjdk.samtools.cram.encoding.rans htsjdk.samtools.cram.encoding.reader htsjdk.samtools.cram.encoding.readfeatures htsjdk.samtools.cram.encoding.writer htsjdk.samtools.cram.io htsjdk.samtools.cram.lossy htsjdk.samtools.cram.ref htsjdk.samtools.cram.structure htsjdk.samtools.example htsjdk.samtools.fastq htsjdk.samtools.filter htsjdk.samtools.liftover htsjdk.samtools.metrics htsjdk.samtools.reference htsjdk.samtools.seekablestream htsjdk.samtools.util htsjdk.samtools.util.ftp htsjdk.samtools.util.zip htsjdk.tribble htsjdk.tribble.annotation htsjdk.tribble.bed htsjdk.tribble.example htsjdk.tribble.exception htsjdk.tribble.gelitext htsjdk.tribble.index htsjdk.tribble.index.interval htsjdk.tribble.index.linear htsjdk.tribble.index.tabix htsjdk.tribble.readers htsjdk.tribble.util htsjdk.tribble.util.popgen htsjdk.variant.bcf2 htsjdk.variant.utils htsjdk.variant.variantcontext htsjdk.variant.variantcontext.filter htsjdk.variant.variantcontext.writer htsjdk.variant.vcf